Køge-Fonden bestyrelse udgøres af 2 repræsentanter for de 4 lokalområder, hvor der drives arkiv (Herfølge, Højelse, Skovbo og Køge købstad). Repræsentanterne udpeges af den lokalhistoriske forening, hvor der findes en sådan. Derudover sammensættes bestyrelsen af 2 medlemmer af Køge byråd samt udpegede medlemmer med kompetencer indenfor erhverv, regnskab og bygningsbevaring.
Forretningsudvalg:
- Mogens Pejtersen, formand – Økonomi og erhverv
- Laila Christensen, næstformand – Erhverv og kultur
- Bo Michael Hansen – Lokalhistorisk Forening for Herfølge-Sædder Sogne
- Leif Lørring – Skovbo Lokalhistoriske Forening
- Karsten Vibild – Bygningsbevaring
- Marianne Iversen – Køge Byarkivs Venner
- Erling Larsen – Højelse Sognearkiv
Øvrige bestyrelsesmedlemmer:
- Marie Stærke – Borgmester, Køge Byråd
- Ken Kristensen – Køge Byråd
- Claes Lagerbon Jensen – Jura og Erhverv
- Vibeke Krogsgaard – Køge Byarkivs Venner
- Hanne Hansen – Højelse Sognearkiv
- Søren Windahl – Økonomi og regnskab
- Terri Nielsen – Skovbo Lokalhistoriske Arkiv
- Sonja Zingg Hansen – Lokalhistorisk forening for Herfølge-Sædder Sogne